Trước đây, Ea Pô là một xã thuộc thị xã Buôn Ma Thuột, được thành lập vào ngày 26 tháng 1 năm 1989 trên cơ sở tách một phần diện tích và dân số của xã Cư Jút cũ.

Ngày 19 tháng 6 năm 1990, Hội đồng Bộ trưởng ban hành Quyết định 227-HĐBT[3]. Theo đó, chuyển xã Ea Pô về huyện Cư Jút mới thành lập, đồng thời sáp nhập 35.100 ha diện tích tự nhiên của xã Đắk Lao thuộc huyện Đắk Mil vào xã Ea Pô.

Sau khi điều chỉnh địa giới hành chính, xã Ea Pô có 49.845 ha diện tích tự nhiên và 1.800 người.

Ngày 15 tháng 8 năm 2001, Chính phủ ban hành Nghị định 49/2001/NĐ-CP[2]. Theo đó, thành lập xã Đắk Wil trên cơ sở 42.140 ha diện tích tự nhiên và 5.159 người của xã Ea Pô.

Sau khi điều chỉnh địa giới hành chính, xã Ea Pô còn lại 10.010 ha diện tích tự nhiên và 9.189 người.